Protokol z praktik Mikrobiologie 2, zimní semestr 2016/2017 Markéta Novotná a Viktoria Reklová, 3005 28. 11. – 2. 12. 2016 SADA III. 1. MOČ 88letá pacientka na geriatrii, se zavedenou močovou cévkou, teplota 38, spavá, ke kultivaci poslána kalná moč. 1. den jsme si naočkovaly moč na močovou destičku (žluč-eskulinový agar, krevní agar, Endova půda). 2. den jsme identifikovaly, že jde o Gram negativní bakterii, jelikož rostla jak na krevním agaru, tak na Endově půdě. Zároveň jsme odečetly počet kolonií na destičce jako 10 7 kolonií/ml, jde tedy již o infekci. Abychom mohly dále identifikovat druh bakterie, provedly jsme OF test. Zároveň jsme si udělaly citlivost na antibiotika. 3. den jsme měly výsledky OF testu – jedná se o fermentující bakterii. Provedly jsme tedy ještě OXI test, kdy byla bakterie oxidáza negativní. Abychom ji však identifikovaly dále, provedly jsme Enterotest. Odečetly jsme i výsledky citlivosti na antibiotika: Ceftazidime – 23 mm – citlivý Meropenem – 18 mm – citlivý Contrimoazol – 25 mm – citlivý Amoxicilin – rezistentní 4. den jsme odečetly výsledky Enterotestu, kterým jsme identifikovaly bakterii Klebsiella pneumoniae. Pacientce bychom doporučily výměnu cévky. Jelikož je pacientka febrilní, doporučily bychom parenterální podání antibiotik Contrimoxazolu, abychom předešly úpadku do sepse. V případě, že by tato antibiotika nezabrala, daly bychom ještě Gentamicin. 2. + 3. SPUTUM + HEMOKULTURA 50 letý pacient, bezdomovec, alkoholik, přijat pro dušnost, kašel, febrilie 40 st., CRP 400, hypotenzní, dle RTG rozsáhlá pravostranná pneumonie 1. den jsme si naočkovaly sputum na močovou destičku a hemokulturu na krevní agar. Již z dodaných vzorků hemokultury jsme identifikovaly, že jde o Gram pozitivní bakterii, jelikož nerostla na Endově půdě. Provedly jsme i krevní nátěr, kterým jsme prokázaly bakterii rodu Streptococcus. 2. den jsme odečetly výsledky hemokultury na krevním agaru, kdy jsme zjistily, že jde o alfa hemolyzující bakterii Streptococcus. Máme podezření, že jde od Strepotococcus pneuomoniae. Abychom si naši diagnózu potvrdily či vyvrátily, provedly jsme Optochinový test. Z naočkovaného sputa jsme zjistily infekci asi 10 6 kolonií/ml, stejné bakterie jako na hemokultuře. Udělaly jsme si i citlivost na antibiotika. 3. den jsme z výsledků Optochinového testu, který byl pozitivní, identifikovaly bakterii jako Streptococcus pneumoniae. Výsledky citlivosti na antibiotika jsme odečetly následovně: Cefoxitin – 25 mm – citlivý Oxacillin – rezistentní Ampicillin – rezistentní Erythromycin – rezistentní Contrimoxazol – rezistentní Klindamycin – rezistentní Jako citlivé antibiotikum nám vyšel pouze Cefoxitin, což je ale ATB pro stafylokoky. Proto bychom léčily pacienta raději Penicilin. 4. STOLICE 25letý pacient s Crohnovou chorobou, akutní exacerbace, 20 průjmových stolic za den 1. den jsme stolici naočkovaly na krevní agar, na Endovu půdu a na DC agar. 2. den jsme zjistily, že jde o Gram negativní bakterii, jelikož vyrostla i na Endově půdě. Abychom identifikovaly bakterii, udělaly jsme si OF test. Zjistily jsme, že na krevním agaru jsou bakterie dvě – plazivě vyrostla ještě jedna bakterie, což nasvědčuje tomu, že jde o rod Proteus. 3. den jsme zjistily, že 1. bakterie je fermentující. Provedly jsme ještě OXI test, kdy byla bakterie oxidáza negativní. Abychom identifikovaly tuto bakterii a druh Protea, udělaly jsme pro obě bakterie Enterotest. Zároveň jsme si udělaly pro obě bakterie citlivost na antibiotika. 4. den jsme z výsledků Enterotestu zjistily, že se jedná o bakterie Proteus mirabilis a Escherichia coli. Citlivost na ATB pro Proteus mirabilis byla následující: Ceftazidime – citlivý Meropenem – citlivý Contrimoxazol – rezistentní Amoxicilin – citlivý Gentamicin - citlivý Ciltivost na ATB pro Escherichia coli byla následující: Ceftazidime - citlivý Meropenem – citlivý Contrimoxazol – citlivý Amoxicilin – citlivý Gentamicin - citlivý Proteus je běžnou flórou GIT, proto pacienta nebudeme léčit. Pro E. coli bychom si dodělali sérotypizaci. 5. STĚR RÁNA 65letý pacient po by-passu pro těžkou formu ICHDK, aferbrilní, rána mírně zarudlá, nevelká sekrece serózní tekutiny 1. den jsme si naočkovaly stěr z rány na krevní agar, Endovu půdu a na žluč-eskulinový agar. 2. den jsme zjistily, že bakterie vyrostla pouze na krevním agaru. Tím jsme určily, že jde o Gram pozitivní bakterii. Jelikož bakterie nevyrostla ani na žluč-eskulinovém agaru, vyloučily jsme tím i možnost Gram pozitivních enterokoků. Abychom odlišily, jestli jde o rod Staphylococcus nebo Streptococcus, provedly jsme katalázový test. Pozorovaly jsme bublinky, průkaz katalázy byl tedy pozitivní a jde o rod Staphylococcus. Abychom rozlišily, jestli jde o Staphylococcus aureus, či o koaguláza negativní stafylokoky, provedly jsme průkaz vázané koagulázy. Test vyšel negativně, jde tedy o koaguláza negativní stafylokoky. Zároveň jsme si udělaly citlivost na antibiotika. 3. den jsme si odečetly výsledky citlivosti na antibiotika, která vyšla následovně: Klindamycin – 23 mm – citlivý Cefoxitin – 6 mm – rezistentní Oxacillin – 6 mm – rezistentní Ampicillin – rezistentní Erythromycin – rezistentní Citlivost na antibiotika nám vyšla pouze pro Klindamycin, proto bychom pacienta léčily tímto antibiotikem. Pokud bychom dalšími testy zjistily, že jde o Staphylococcus epidermidis, což je normální kulturou kůže, pacienta bychom neléčily. Požádaly bychom případně o vzorek přímo z rány.